ГлавнаяИнститутБиблиотека НИИ медицинской генетики

Публикации сотрудников

Просмотреть/скачать публикации сотрудников можно только авторизованным пользователям.

2024

Афанасьев С.А., Корепанов В.А., Бабушкина Н.П., Реброва Т.Ю., Муслимова Э.Ф., Голубенко М.В., Гарганеева А.А., Атабеков Т.А.
Вестник аритмологии. 2024. Т. 31. № 1 С. 71-76.
DOI: 10.35336/VA-1294

Цель. Исследовать функциональную состоятельность митохондрий и полиморфизм митохондриальной ДНК (мтДНК) у пациентов с ишемической болезнью (ИБС), имеющих жизнеугрожающие нарушения ритма сердца (НРС).

Материал и методы исследования. Исследовали венозную кровь 45 пациентов с неосложненной ИБС и 120 пациентов, имеющих ИБС с НРС. Определяли скорости потребления кислорода митохондрий лейкоцитов в состояниях V3 и V4 в пируват-малатном и сукцинатном буферах, а также присутствии пальмитиновой кислоты (ПК). У пациентов с осложнённой ИБС определяли гаплогруппу мтДНК и замены в генах, кодирующих белки комплексов дыхательной цепи и рРНК митохондрий. Статистический анализ результатов проводили, используя тест Манна-Уитни, критерий Вилкоксона и критерий Хи-квадрат с поправкой Йейтса.

Результаты. Cкорость потребления кислорода интактных митохондрии при неосложненной ИБС и ИБС с НРС достоверно не различались ни в пируват-малатном, ни в сукцинатном буферах. При неосложненной ИБС, добавление ПК увеличивает скорость потребления кислорода митохондриями и в сукцинатном, и пируват-малатном буфере. Большинство (41%) пациентов, имеющих ИБС с НРС, являлись носителями гаплогруппы «Н» и по этому показателю рассматриваемая выборка не отличалась от пациентов с неосложнённой ИБС. Однако мтДНК пациентов с осложнённой ИБС характеризовались более частым сочетанным носительством двух и более миссенс-замен в генах дыхательной цепи и рРНК.

Выводы. Митохондрии пациентов с ишемической болезнью и жизнеугрожающими нарушениями ритма сердца имеют сниженный функциональный резерв. Распределение частот основных гаплогрупп мтДНК пациентов, имеющих ишемическую болезнь с жизнеугрожающими нарушениями ритма сердца, соответствует популяционному. Для мтДНК таких пациентов характерна высокая частота носительства сочетанных полиморфизмов в генах белков электрон-транспортной цепи и рРНК.

Читать в источнике

Murtazina A.F., Borovikov A.O., Kuchina A., Ovsova O.V., Bulakh M.V., Chukhrova A.L., Braslavskaya S., Ryzhkova O., Skryabin N.A., Kutsev S.I., Dadali E.L.
International journal of molecular sciences. 2024. 25(1), 129.
DOI: 10.3390/ijms25010129

The HOXB1 gene encodes a homeobox transcription factor pivotal in the development of rhombomere 4. Biallelic pathogenic variants in this gene are associated with congenital facial paresis type 3 (HCFP3). Only seven single nucleotide variants have been reported in the literature to date. Here, we report a 27-year-old female with a unique presentation of HCFP3 with two novel compound-heterozygous missense variants: c.763C>G, p.(Arg255Gly), which arose de novo and an inherited c.781C>T, p.(Arg261Cys) variant. The patient exhibited HCFP3 symptoms with mild upward esodeviation and lacked the documented ear malformations common in HCFP. For many years, she was misdiagnosed with facio-scapulo-humeral muscular dystrophy, due to complaints of shoulder girdle and neck muscle weakness. No alternative genetic or acquired causes of neck and shoulder girdle weakness were found, suggesting its potential inclusion in the phenotypic spectrum.

Читать в источнике

Zakharova, I.S.; Shevchenko, A.I.; Arssan, M.A.; Sleptcov, A.A.; Nazarenko, M.S.; Zarubin, A.A.; Zheltysheva, N.V.; Shevchenko, V.A.; Tmoyan, N.A.; Saaya, S.B.; Ezhov, M.V.; Kukharchuk, V.V.; Parfyonova, Y.V.; Zakian, S.M.
International Journal of Molecular Sciences. 2024, 25(2), 689.
DOI: 10.3390/ijms25020689

Defects in the low-density lipoprotein receptor (LDLR) are associated with familial hypercholesterolemia (FH), manifested by atherosclerosis and cardiovascular disease. LDLR deficiency in hepatocytes leads to elevated blood cholesterol levels, which damage vascular cells, especially endothelial cells, through oxidative stress and inflammation. However, the distinctions between endothelial cells from individuals with normal and defective LDLR are not yet fully understood. In this study, we obtained and examined endothelial derivatives of induced pluripotent stem cells (iPSCs) generated previously from conditionally healthy donors and compound heterozygous FH patients carrying pathogenic LDLR alleles. In normal iPSC-derived endothelial cells (iPSC-ECs), we detected the LDLR protein predominantly in its mature form, whereas iPSC-ECs from FH patients have reduced levels of mature LDLR and show abolished low-density lipoprotein uptake. RNA-seq of mutant LDLR iPSC-ECs revealed a unique transcriptome profile with downregulated genes related to monocarboxylic acid transport, exocytosis, and cell adhesion, whereas upregulated signaling pathways were involved in cell secretion and leukocyte activation. Overall, these findings suggest that LDLR defects increase the susceptibility of endothelial cells to inflammation and oxidative stress. In combination with elevated extrinsic cholesterol levels, this may result in accelerated endothelial dysfunction, contributing to early progression of atherosclerosis and other cardiovascular pathologies associated with FH.

Читать в источнике

2023

Корепанов В.А., Атабеков Т.А., Голубенко М.В., Афанасьев С.А.
Байкальский медицинский журнал. 2023. Т. 2. № S3. С. 65-67.
DOI: 10.57256/2949-0715-2023-3-65-67

Введение. Ишемическая болезнь сердца (ИБС) является наиболее распространенной патологией в структуре сердечно-сосудистых заболеваний. Ишемия является триггером для возникновения нарушений ритма сердца (НРС), требующих имплантации кардиовертеров-дефибрилляторов. Функционирование кардиомиоцитов тесно сопряжено с дыхательными процессами в митохондриях (Мтх). В норме все Мтх в организме человека несут одинаковый геном – митохондриальную ДНК (мтДНК), соответственно функциональные возможности всех Мтх в пределах организма схожи. Носительство полиморфных вариантов генов, кодирующих субъединицы комплексов дыхательной цепи и рРНК, может отражаться на функциональных возможностях Мтх.

Читать в источнике

Tikhonov D.G., Zakharova R.N., Sivtseva T.M., Golubenko M.V., Semenov S.I., Sydykova L.A., Afanasiev M.M., Fedorova S.A., Osakovsky V.L.
Opera Medica et Physiologica. 2023. 10(3), 23-31.
DOI: 10.24412/2500-2295-2023-3-23-3

The Republic of Sakha (Yakutia), located in the northeastern part of Russia, is characterized by an extremely cold climate, to which the indigenous people is adapted. Over the past decades, there has been a significant increase of the incidence of type 2 diabetes mellitus (T2DM) among the indigenous population. It is known that polymorphisms of the mitochondrial genome, in particular, the 16189C variant of hypervariable segment I (HVS-I), may contribute to the development of T2DM. The aim of the study was to assess the association of mitochondrial DNA (mtDNA) HVS-I polymorphisms with the type 2 diabetes mellitus in the Sakha (Yakut) population. Sequencing of HVS-I mtDNA in 102 patients with T2DM and 101 non-diabetic controls revealed 67 haplotypes and 64 SNP variants. There was no statistically significant difference in the frequencies of detected HVS-I polymorphisms and haplotypes between the two groups, which indicates the absence of a close association between HVS-I polymorphisms and T2DM in the Sakha population.

Читать в источнике

Тихонов Д.Г., Егоров А.Н., Голубенко М.В., Молоков А.Ю., Белявская В.А., Гервас П.А., Скрябин Н.А.
Сибирский онкологический журнал. 2023. Т. 22. № 6. С.74-82.
DOI: 10.21294/1814-4861-2023-22-6-74-82

Популяция саха (якуты) – коренное население Сибири, проживающее на территории Якутии, отличается одним из самых низких в мире уровнем заболеваемости раком молочной железы (РМЖ). Низкий уровень заболеваемости РМЖ коренного населения Якутии отмечен в ряде публикаций, но до настоящего времени причины этого явления не до конца выяснены. Следует отметить, что изучение факторов, снижающих риск заболевания РМЖ, имеет важное значение для его профилактики. По результатам ряда исследований, у якутов не обнаружено наследственных форм РМЖ, не найдено патогенных вариантов генов BRCA1/2, ассоциированных с наследственными синдромами РМЖ и рака яичника (РЯ). В связи с этим мы приняли решение сместить акцент на исследование митохондриального генома больных РМЖ саха методом секвенирования. Цель исследования – выявить варианты митохондриального генома, ассоциированные с РМЖ, у пациенток саха. Материал и методы. В исследование включено 14 пациенток саха с диагнозом РМЖ, средний возраст составил 49 лет. Выделение ДНК осуществляли методом фенол-хлороформной экстракции. ДНК-библиотеки готовили с помощью набора Nextera Flex (Illumina, США). Полногеномное секвенирование митохондриального генома выполнялось на приборе MiSeq (Illumina, США) на базе ЦКП Томского НИМЦ. Полученные результаты у больных РМЖ сравнивались с популяционным контролем. Результаты. У женщин саха, больных РМЖ, выявлено 159 вариантов митохондриального генома, отличающихся от референсной последовательностью митохондриальной ДНК (мтДНК) человека (rCRS). Показана ассоциация вероятно патогенных вариантов m.3736G>A гена МТ-ND1 и m.7279T>C гена MT-CO1 с РМЖ. Впервые выявлены варианты, предрасполагающие к РМЖ (m.10398A>G; m.14783T>C; m.15043G>A; m.15301G>A). Особенностью митохондриального генома популяций с низким уровнем заболеваемости РМЖ является высокий уровень вариантов мтДНК с изменением длины полицитозинового участка в локусе D310. Заключение. Впервые у женщин с РМЖ из популяции саха выявлены варианты мтДНК с изменением длины полицитозинового тракта в локусе D310 и вероятно патогенные варианты m.3736G>A гена МТ-ND1 и m.7279T>C гена MT-CO1. Полученные данные свидетельствуют о целесообразности дальнейшего изучения роли выявленных вариантов мтДНК в развитии РМЖ на расширенной выборке пациентов саха.

Читать в источнике

Шипулина С.А., Гончарова И.А., Панфилов Д.С., Козлов Б.Н., Суходоло И.В., Назаренко М.С.
Якутский медицинский журнал. 2023. № 4. С. 13-16.
DOI: 10.25789/YMJ.2023.84.03

Проведена оценка паттерна и интенсивности кальцификации различных зон восходящей аорты у пациентов с ее аневризмой гистологически с помощью окрашивания ализариновым красным. Биоптаты, соответствующие трем зонам восходящей аорты, были получены от пациентов интраоперационно. В восходящей аорте соли кальция распределялись диффузно и обнаруживались в медии сосуда. Средний процент кальцификации для синотубулярного соединения (зона 1) 7,85%, на уровне бифуркации легочного ствола (зона 2) 10,45%, в проксимальной части дуги аорты (зона 3) 10,95 % (p=0,216). Пациенты, у которых максимальная кальцификация обнаруживалась в зоне 3, были моложе пациентов с максимальной кальцификацией в зоне 2 или зоне 1.

Читать в источнике

Васильев С.А., Васильева О.Ю., Оппонг-Пепрах Б., Деменева В.В., Зуев А.С., Саженова Е.А., Никитина Т.В., Толмачева Е.Н.
Вестник РУДН. Серия: Медицина. 2023. Т. 27. № 4. С. 515-531.
DOI: 10.22363/2313–0245–2023–27–4–515–531

Актуальность. Нарушения эпигенетической регуляции генов, ответственных за развитие эмбриона и плаценты, ассоциированы со многими патологиями беременности. Цель. Целью настоящей работы стал анализ распространенности нарушений метилирования генов PRDM16 и PTPRN2 в ворсинах хориона спонтанных абортусов с нормальным кариотипом и с наиболее частыми анеуплоидиями (трисомия 16 и моносомия X). Материалы и методы. Оценка профиля метилирования была проведена с помощью таргетного бисульфитного массового параллельного секвенирования в ворсинах хориона медицинских абортусов (n=10), спонтанных абортусов с нормальным кариотипом (n=39), трисомией 16 (n=17) и моносомией X (n = 20) и лимфоцитов периферической крови здоровых добровольцев (n=6). Результаты и обсуждение. Было обнаружено дифференциальное метилирование отдельных CpG-сайтов в изученных генах в ворсинах хориона спонтанных абортусов. Несмотря на отсутствие значимых отличий между группами по среднему уровню метилирования в изученных регионах генов, отклонения уровня метилирования генов PRDM16 и PTPRN2 были выявлены для 33 % и 5 % спонтанных абортусов, соответственно, что указывает на высокую частоту распространения эпигенетических аномалий по этим генам в ворсинах хориона спонтанных абортусов. Уровень метилирования гена PRDM16  значимо коррелировал с уровнем метилирования ретротранспозона LINE‑1, что указывает на генерализованный характер нарушений метилирования у спонтанных абортусов. Наконец, уровень метилирования гена PTPRN2 зависел от возраста матерей спонтанных абортусов с моносомией X, что поднимает вопрос о влиянии материнских факторов на профиль метилирования в этой группе спонтанных абортусов. Выводы. Полученные результаты указывают, что эпигенетические нарушения гена PRDM16 могут быть связаны со спонтанным прерыванием беременности в первом триместре.

Читать в источнике

Минайчева Л.И., Петлина Е.Ю., Равжаева Е.Г., Сеитова Г.Н.
Русский журнал детской неврологии. 2023. Т. 18. № 2-3. С. 31-37.
DOI: 10.17650/2073-8803-2023-18-2-3-3-31-37

Прогрессирующая мышечная дистрофия Дюшенна – генетически обусловленное фатальное заболевание с неуклонно прогрессирующим течением. Характеризуется отсутствием белка дистрофина или резким снижением (<3 % от нормы) его уровня. В России в последние годы появилось несколько препаратов для патогенетического лечения миодистрофии Дюшенна. К сожалению, данная терапия не является универсальной и может быть назначена пациентам с определенными видами и участками мутаций. Установление точного диагноза в каждом конкретном случае позволит своевременно определить наиболее оптимальную тактику ведения больного, включая эффективные профилактические и реабилитационные мероприятия, получить патогенетическое лечение, а в перспективе – генную терапию. В настоящей статье описаны клинические случаи миопатии Дюшенна у пациентов с различными вариантами мутаций в гене дистрофина на фоне проведения патогенетической терапии.

Читать в источнике

Семченко В.В., Ерениев С.И., Лебедев И.Н., Сосновская Е.В., Ланичева А.Х.
Журнал функциональной морфологии и интегративной антропологии им. Б.А. Никитюка. 2023. № 1. С. 63-70.

Недостаток и в ряде дисциплин фактическое отсутствие научно-методической и учебной литературы по вопросам клеточных технологий, фрагментарное чтение лекций по современным проблемам регенеративной биологии и медицины и не во всех образовательных учреждениях страны, отсутствие учебных программ по клеточным технологиям и систематизированного понятийного аппарата в учении о стволовых клетках и их дериватах, генно-клеточной терапии побуждает авторов частично восполнить этот пробел настоящей публикацией. Цель данной работы – изложить основные термины и определение понятий, используемых в практике регенеративной биомедицины, в учении о стволовых клетках, унифицировать и сформировать понятийный аппарат применительно к стволовым клеткам и генно-клеточным технологиям. 


Пристяжнюк И.Е., Мещеряков Н.И., Никитина Т.В., Толмачёва Е.Н., Минайчева Л.И., Назаренко Л.П., Лебедев И.Н., Мензоров А.Г.
Онтогенез. 2023. Т. 54. № 6. С. 397-404.
DOI: 10.31857/S0475145023060071

Дифференцировка индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК), полученных от пациентов и условно здоровых доноров, позволяет изучать генетические аномалии in vitro. Ранее мы описали клинический случай привычного невынашивания беременности у пациентки с асимметричной инактивацией Х-хромосомы в периферических лимфоцитах, буккальном эпителии и эндометрии. C помощью aCGH мы выявили микроделецию в Xq24 размером 239 т.п.н., затрагивающую восемь генов, включая UBE2A. Мы получили линию ИПСК iTAF15Xsk4 из фибробластов кожи пациентки с помощью не интегрирующихся эписомных векторов. Линия ИПСК имела нормальный кариотип, экспрессировала маркеры плюрипотентности и при дифференцировке в эмбриоидные тельца экспрессировала маркеры всех трех зародышевых листков. Полученную линию можно использовать для изучения синдрома дефицита гена UBE2A.

Читать в источнике

Хомякова Е.А., Федоренко А.В., Сурдина А.В., Воловиков Е.А., Беликова Л.Д., Зеркаленкова Е.А., Лагарькова М.А., Богомазова А.Н.
Онтогенез. 2023. Т. 54. № 6. С. 405-414.
DOI: 10.31857/S0475145023060046

Делеции и мутации в гене UBE2A вызывают Х-сцепленный синдром умственной отсталости типа Насименто, впервые описанный в 2006 г. (Nascimento et al., 2006). На настоящий момент известно около двух десятков миссенс- и нонсенс-мутаций в гене UBE2A, ассоциированных с синдромом умственной отсталости по типу Насименто (Cordeddu et al., 2020). Для изучения роли гена UBE2A в развитии центральной нервной системы мы создали линию индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК) человека с нокаутом гена UBE2A (RCPCMi009-A-1) с использованием технологии редактирования генома CRISPR/Cas9. Нокаут гена UBE2A был подтвержден Вестерн-блоттингом. Плюрипотентность линии ИПСК RCPCMi009-A-1 была подтверждена типичной морфологией плюрипотентных стволовых клеток, нормальным кариотипом (46,XY), экспрессией маркеров плюрипотентности и способностью дифференцироваться в производные трех зародышевых листков.

Читать в источнике

Кучер А.Н., Назаренко М.С.
Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины. 2023. Т. 38. № 4. С. 61–69.
DOI: 10.29001/2073-8552-2023-38-4-61-69

Сердечная недостаточность (СН) – широко распространенный синдром, приводящий к существенному снижению качества жизни пациентов. Одним из перспективных направлений в изучении СН является эпигенетика, позволяющая рассматривать патогенез данного синдрома на новом молекулярном уровне. Настоящей обзор посвящен обобщению исследований, связанных с изучением эпигенетических процессов (модификация гистонов, метилирование ДНК, изменение экспрессии регуляторных некодирующих РНК), сопровождающих развитие СН. Эпигенетические исследования СН не только подтвердили клиническую и этиологическую гетерогенность данного синдрома, но и расширили спектр маркеров, потенциально значимых для диагностики, а также открыли новые стратегии разработки лекарственных препаратов.

Читать в источнике

Кучер А.Н., Назаренко М.С.
Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины. 2023. Т. 38. № 2. С. 38-43.
DOI: 10.29001/2073-8552-2023-38-2-38-43

Сердечная недостаточность (СН) – широко распространенный синдром, характеризующийся этиологической и клинической гетерогенностью. Обзор посвящен рассмотрению генетических  факторов, лежащих в основе развития этого патологического состояния. Результаты современных молекулярно-генетических исследований подтверждают этиологическую сложность и клиническую гетерогенность СН. Выявление  носительства редких патогенных вариантов, лежащих в основе развития СН среди пациентов и  их родственников, важны для своевременной  корректировки образа жизни и разработки профилактических мероприятий по снижению  риска данного синдрома и его осложнений. 

Читать в источнике

ГремяковаТ.А., Артемьева С.Б., Байбарина Е.Н., Вашакмадзе Н.Д., Гузева В.И., Гусакова Е.В., Кузенкова Л.М., Лаврова А.Е., Львова О.А., Михайлова С.В., Назаренко Л.П., Никитин С.С., Поляков А.В., Дадали Е.Л., Румянцев А.Г., Сакбаева Г.Е., Суслов В.М., Гремякова О.И., Степанов А.А., Шаховская Н.И.
Нервно‑мышечные болезни. 2023. 13(2), 10-19.
DOI: 10.17650/2222‑ 8721‑2023‑13‑2‑10‑19

Мышечная дистрофия Дюшенна – генетическое орфанное нервно‑мышечное заболевание, обусловленное мутацией гена DMD, кодирующего белок дистрофин. В результате развивающегося и прогрессирующего повреждения и атрофии мышц дети теряют способность ходить, у них развиваются респираторные и кардиологические нарушения. При условии ранней диагностики медицинская помощь, направленная на максимально продолжительное сохранение амбулаторности пациента, при терапии глюкокортикостероидами и реабилитационных мероприятиях для предупреждения сердечно‑легочных осложнений и остеопороза существенно меняет траекторию развития заболевания. Эффективность новых препаратов генной таргетной терапии миодистрофии Дюшенна, частично восстанавливающих синтез полноразмерного или редуцированного дистрофина, зависит от их своевременного и адекватного использования в сочетании с комплексной медицинской помощью, рекомендованной для данной нозологии.

Читать в источнике

1 2 3 4 ... 94