The study was aimed to estimate the relationship between the prevalence of allergic disease and helminth invasion by the trematode Opisthorchis felineus in rural and urban populations of Tomsk Oblast (West Siberia, Russia). Two hundred and one people from Kargasok village of Tomsk Oblast and 196 from the city of Tomsk were screened for the presence of atopy and O. felineus invasion. Opisthorchosis was found in 66 participants (32.8%) from Kargasok and in 22 people (11.2%) from Tomsk. Atopic diseases were more common in the urban population than in the rural: 52.8 and 31.4%, respectively. Positive skin-prick tests were significantly higher in the urban population than in rural people: 83.2 vs 24.4%, respectively. It was found that in the city, the presence of antibodies to O. felineus negatively correlates with the atopic sensitization by skin-prick tests. However, in the village, opisthorchosis was positively associated with atopic diseases. The data obtained confirm the negative association of rural lifestyle and atopic diseases prevalence and indicate that O. felineus invasion might be a modifying factor of this relationship in Tomsk Oblast.

Native Americans derive from a small number of Asian founders who likely arrived to the Americas via Beringia. However, additional details about the initial colonization of the Americas remain unclear. To investigate the pioneering phase in the Americas we analyzed a total of 623 complete mtDNAs from the Americas and Asia, including 20 new complete mtDNAs from the Americas and seven from Asia. This sequence data was used to direct high-resolution genotyping from 20 American and 26 Asian populations. Here we describe more genetic diversity within the founder population than was previously reported. The newly resolved phylogenetic structure suggests that ancestors of Native Americans paused when they reached Beringia, during which time New World founder lineages differentiated from their Asian sister-clades. This pause in movement was followed by a swift migration southward that distributed the founder types all the way to South America. The data also suggest more recent bi-directional gene flow between Siberia and the North American Arctic.

Изучено распределение аллелей и генотипов двух генов алкогольдегидрогеназ – ADH1B (полиморфизм A/G (47His) в 3-м экзоне), ADH7 (полиморфизм G/C в 5-м интроне) и гена цитохрома Р450 2Е1 (CYP2E1, полиморфизмы G/C в 5-фланкирующем регионе и Т/А в 6-м интроне) в выборках из русской популяции г. Томска: здоровые индивиды (n = 125) и больные с диагнозом “ишемическая болезнь сердца и коронарный атеросклероз” (КА, n = 92). В контрольной выборке частоты аллелей этих генов удовлетворяют равновесию Харди–Вайнберга и равновесию по сцеплению (гаметическому равновесию) для сочетаний пар генов, за исключением полиморфизмов гена CYP2E1, которые сцеплены. В общей контрольной выборке “мутантные” аллели ADH1B*G (+MslI), CYP2E1*C2 (+PstI) и CYP2E1*С (–DraI) встречаются с низкой частотой (8.48 ± 1.86, 1.20 ± 0.69 и 10.00 ± 1.90% соответственно). Полиморфизм гена ADH7 характеризуется высоким уровнем гетерозиготности, частота аллеля ADH7*C (–StyI) составила 44.58 ± 3.21%. В группе больных КА обнаружена повышенная частота аллеля С2 полиморфизма CYP2E1 PstI ( в 4 раза; Р = 0.043), который связан с более высокой транскрипционной и ферментативной активностью (OR = 4.23, 95% CI 1.03–20.01). Выявлена близкая к статистически значимой ассоциация генотипа А1А2 полиморфизма ADH1B MslI со сниженным систолическим давлением (Р = 0.068). Обнаружены эффекты взаимодействующих локусов ADH7 StyI и CYP2E1 DraI на диастолическое давление (Р = 0.029) и на содержание липопротеидов высокой плотности (Р = 0.042), а также влияние генотипа А1А2 полиморфизма ADH1B MslI на пониженное содержание липопротеидов очень низкой плотности (P = 0.045), что обусловлено, вероятно, полифункциональностью этих ферментов и вовлеченностью во многие метаболические и свободно-радикальные процессы в организме.

Изучение генетики целиакии последнее десятилетие характеризуется поиском новых генов подверженности к болезни, не относящихся к главному комплексу гистосовместимости. Остается малоизученным вопрос о влиянии полиморфизма генов-модификаторов иммунного ответа на развитие заболевания и его клинические проявления, что представляет как научный, так и практический интерес. В исследование было включено 50 детей и подростков больных целиакией в возрасте от 9 мес до 19 лет, родственники 1-й степени родства (86 родственников из 35 семей). Маркеры целиакии по HLA-системе выявлены у всех больных с целиакией Томска. Гены-модификаторы иммунного ответа определяют тип, течение целиакии, компенсацию на фоне безглютеновой диеты, а также развитие осложнений и требуют дальнейшего изучения

Цель работы - установить значение полиморфизмов -703С/Т гена IL-5, 551Q/R гена IL4RA, генов биотрансформации ксенобиотиков (GSTM1, GSTT1), а также комбинации изучаемых генотипов в формировании подверженности к бронхиальной астме (БА) у детей, страдающих атопическим дерматитом (АД). В исследовании использовалось генотипирование по полиморфизмам -703С/Т гена интерлейкина-5 (IL-5), 551Q/R гена 1L4RA, глутатион S-трансфераз Ml (GSTM1) и GSTT1 в группах пациентов с АД (п = 72; средний возраст 9,4 + 0,28 года), больных БА в сочетании с АД (я = 68; средний возраст 7,5 + 0,7 года) и в контрольной выборке (п = 147; средний возраст 9,9 + 0,42 года). Установлена рисковая значимость аллеля -703С гена IL-5 и комбинации генотипов -703СС / 551RR в отношении БА у детей с АД (OR = 1,73 при р = 0,013 и OR - 3,15 при р = 0,015 соответственно). Генотип 551RR гена IL4RA связан с подверженностью развитию аллергических заболеваний у детей (р < 0,05). Комбинация генотипов -703СТ/ GSTT1 О/О реже встречалась у больных БА в сравнении с контролем (OR = 0,15; р - 0,049). Аллель -703С гена 1L-5 и комбинации генотипов -703СС / 551RR генов IL-5 и IL4RA ассоциированы с развитием БА у больных АД, а генотип 551RR гена IL4RA - с подверженностью аллергической патологии в детском возрасте, что может иметь значение для обоснованного назначения мероприятий первичной профилактики. Сочетание генотипов -703CT/GSTT1 О/О имеет протективное значение в развитии БА.

Анализ наследственных основ атопических заболеваний (A3) - одна из наиболее активно развиваемых областей генетики человека. Проведенные в течение более полувека исследования позволили выдвинуть концепцию о трех относительно независимых компонентах структуры наследственной подверженности к A3, предрасполагающих к атопии как таковой, к развитию воспалительных реакций и к проявлению симптомов и эндофенотипов ""органной специфичности"" A3 Вероятность развития конкретного A3 определяется индивидуальными особенностями функционирования этих трех кластеров генов. На сегодняшний день получены данные 12 полногеномных скринингов для A3, изучено более 250 генов-кандидатов, с помощью позиционного клонирования идентифицировано 4 новых гена A3 (ADAM33, PHF11, DPP10 и GPRA). Несколько исследований по масштабному анализу уровня экспрессии генов у больных A3 и на модельных объектах позволили предположить, что число наиболее значимых генов, предрасполагающих к развитию A3, не превышает 150. В настоящее время наблюдается некоторое снижение исследовательской активности в отношении генетики A3, связанное с достаточно большим объемом уже имеющихся знаний в этой области. В тоже время заметны усилия е направлении прикладных разработок для лечения и диагностики A3 на основе геномных и постгеномных технологий. В частности, ведутся клинические испытания препаратов, основанных на антисмысловом ингибировании и рибозимном расщеплении мРНК генов A3. Таким образом, успехи по расшифровке структуры наследственной подверженности A3 уже сегодня способствуют разработке новых лекарственных средств, потенциально более эффективных и безопасных по сравнению с уже имеющимися.

Больные сахарным диабетом 1 типа русского населения Томской области достоверно чаще являются носителями аллеля С полиморфного маркера С/Т гена нейрональной синтазы NO, аллеля В полиморфного маркера VNTR, аллеля С полиморфного маркера С691Т, аллеля С полиморфного маркера С774Т и аллеля G полиморфного маркера G894Т гена эндотелиальной синтазы NO. Получены следующие ассоциации иммунологических показателей с полиморфными маркерами: CD4/CD8 – VNTR, поглотительная способность нейтрофилов – C774T, поглотительная способность нейтрофилов – G894T гена эндотелиальной синтазы NO.

Целью исследования явился анализ ассоциации ∆32 полиморфизма гена CCR5 с риском развития рассеянного склероза у русских и якутов, проживающих на территории Республики Саха (Якутия). Материалы и методы. Обследованы 63 больных с достоверным диагнозом рассеянный склероз в соответствии с критериями Мак-Дональда и неродственные здоровые лица, отобранные на основании сходства с больными по признакам возраста, пола и национальности (253 чел.). Генотипирование по полиморфному варианту ∆32 гена CCR5 проводили с помощью полимеразной цепной реакции. Результаты. В популяции якутов не выявлено носителей делеции в гене CCR5. У русских, проживающих на территории Якутии, частота аллеля CCR5∆32 составляет 9,1%. Показано увеличение скорости прогрессирования у CCR5∆32-позитивных больных в сравнении с CCR5∆32-негативными больными (0,61±0,13 против 0,48±0,04).

Статья посвящена анализу генетической предрасположенности к целиакии. Изучены ассоциации генов HLA и генов-модификаторов иммунного ответа (интерлейкина 1, антагониста рецептора интерлейкина 1, интерлейкина 4, а-субъединицы рецептора интерлейкина 4, рецептора к витамину d) с предрасположенностью к болезни, а также с вариантами ее течения и сопутствующими аутоиммунными заболеваниями (аутоиммунным тиреоидитом, сахарным диабетом типа 1).

Проанализирована ассоциация полиморфных вариантов генов IL4, IL4RA, IL12B, TNFa, NRAMP1 с морфологическими особенностями течения хронических вирусных гепатитов. Рассмотрена функциональная значимость исследуемых генов в фенотипической изменчивости количественных признаков, таких как интерфeрон-у (IFN/), фактор некроза опухолей-a (ФНО(z), интсрлейкин-4 (IL4), интерлейкин-2(IL2), интерлейкин-10 (IL10), интерлейкин-6 (IL6), интерлейкин-12 (IL12).

Известно, что фетальная ДНК присутствует в плазме и сыворотке беременных женщин. Недавно было продемонстрировано, что основная часть циркулирующих нуклеиновых кислот в крови здоровых доноров связана с поверхностью форменных элементов крови. В настоящем исследовании мы изучили характер распределения фетальной и материнской внеклеточной ДНК в крови беременных женщин, вынашивающих здоровые плоды и не имеющих осложнений течения беременности. Впервые показано, что фетальная ДНК присутствует на поверхности клеток материнской крови, однако большая часть внеклеточной ДНК, локализованной на поверхности форменных элементов, представлена ДНК материнского происхождения. В крови беременных женщин при нормально протекающей беременности основная часть внеклеточной ДНК плода (более 60%) и матери (более 80%) связана с поверхностью форменных элементов. Концентрация внеклеточной ДНК, локализованной на поверхности клеток крови, возрастает с течением беременности, тогда как связи между уровнем ДНК плода и возрастом беременной женщины не наблюдается. Обсуждается значимость динамики фракций внеклеточной ДНК в крови беременных женщин для разработки протоколов неинва-зивной пренатальной диагностики нарушений развития плода.

В рамках исследования полиморфизма генов, ответственных за функционирование отдельных факторов эндотелиальной системы, были изучены частоты амельных вариантов генов метилентетрагидрофолатредуктазы, ангиотен-зинконвертирующего фермента и эндотелиальной синтазы оксида азота. Гестоз легкой степени тяжести связан с генетическими маркерами С677Т и А1298С гена MTHFR. Найдены ассоциации полиморфных вариантов С677Т и А1298С гена MTHFR и D-аллеля гена А СЕ со среднетяжелой и тяжелой формами гестоза. По локусу А1298С наблюдалось повышение частоты мутантного генотипа (СС) в зависимости от степени тяжести заболевания (гестоза).

Представлены результаты мониторинга врожденных пороков развития (ВПР) за 7-летний период в Томске (1999-2005 гг.), исследованы их структура и распространенность. Определен вклад ВПР плода, выявленных пренатально и прерванных по медицинским показаниям, в общую частоту ВПР.