ГлавнаяИнститутНаучные лабораторииЛаборатория инструментальной геномики

Лаборатория инструментальной геномики

Открыта в 2022 году в рамках реализации Национального проекта "Наука и университеты"


Доктор биологических наук, заместитель директора Томского НИМЦ по развитию; ведущий научный сотрудник, руководитель лаборатории инструментальной геномики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ

Лаборатория инструментальной геномики ставит своей целью разработку инструментов для анализа генома, а также получение новых фундаментальных знаний о геноме, на основе которых будут разработаны новые инструменты диагностики и терапии.

Сотрудники лаборатории

Младший научный сотрудник лаборатории цитогенетики и лаборатории инсрументальной геномики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ.
младший научный сотрудник лаборатории цитогенетики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ, аспирант Томского НИМЦ.
Младший научный сотрудник лаборатории инструментальной геномики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ.
Младший научный сотрудник лаборатории инструментальной геномики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ.
Младший научный сотрудник лаборатории инструментальной геномики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ.
кандидат биологических наук, научный сотрудник инструментальной геномики и лаборатории цитогенетики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ.
биологических наук, научный сотрудник лаборатории инструментальной геномики и лаборатории цитогенетики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ.
Лаборант-исследователь лаборатории инструментальной геномики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ.
Младший научный сотрудник лаборатории инструментальной геномики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ.
Лаборант-исследователь лаборатории инструментальной геномики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ.
Лаборант-исследователь лаборатории инструментальной геномики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ.
Младший научный сотрудник лаборатории инструментальной геномики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ
Младший научный сотрудник лаборатории инструментальной геномики НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ.

Основные направления исследований лаборатории


Разработка ДНК-зондов для диагностики хромосомной патологии
В рамках этого направления разрабатываются отечественные ДНК-зонды для флуоресцентной гибридизации in situ (FISH). ДНК-зонды для проведения флуоресцентной гибридизации in situ (FISH) являются наиболее точным методом выявления хромосомной патологии как в рамках пренатальной диагностики, так и после рождения. В настоящее время в связи с невозможностью поставки зарубежных ДНК-зондов для FISH и отсутствия отечественных аналогов возникла критическая ситуация в диагностике хромосомных болезней. Поэтому необходима разработка отечественной панели ДНК-зондов для диагностики хромосомных болезней.
В лаборатории разрабатываются ДНК-зонды для диагностики хромосомных болезней, включая синдромы Дауна, Патау, Шерешевского-Тернера, микроделеционные синдромы, а также для выявления хромосомных перестроек в злокачественных новообразованиях, которые определяют различные персонализированные схемы лечения.

Изучение фундаментальных и прикладных аспектов эпигенетики индивидуального развития человека
В лаборатории проверяется гипотеза о масштабных нарушениях метилома плаценты, ассоциированных с различными осложнениями беременности. Определяется распространенность нарушений метилирования генов ремоделирования спиральных артерий и морфогенеза плаценты в хорионе спонтанных абортусов и их влияние на экспрессию данных генов. Это даст возможность дополнить картину причин гибели эмбрионов на ранних сроках и роли эпигенетических механизмов в эмбриогенезе. Для исследования используется уникальный сформированный биобанк тканей спонтанных абортусов с контролем кариотипа и самые современные методы анализа метилома и транскриптома.

Разработка методов анализа эпигенетических нарушений при различных формах патологии
Разрабатываются таргетные методы анализа метилирования отдельных участков генома с помощью бисульфитного массового параллельного секвенирования. Накоплен большой опыт анализа профилей метилирования как панелей генов, так и повторяющихся последовательностей, включая ретротранспозон LINE-1, являющийся маркером глобального уровня метилирования генома.

Разработка методов пренатальной и преимплантационной диагностики
В лаборатории разрабатываются отечественные способы пренатальной диагностики хромосомной патологии с помощью ДНК-зондов. Внедряются передовые методы кариотипирования с помощью массового параллельного секвенирования. Разрабатываются новые методы оценки качества бластоцист при использовании вспомогательных репродуктивных технологий с помощью оценки профиля метилирования ДНК.