Областью научных интересов Никитиной Т.В. является изучение причин эмбриональной гибели у человека. Был исследован вклад однородительской дисомии и повышенной частоты соматических мутаций тетрануклеотидных повторяющихся последовательностей ДНК эмбриональную смертность у человека. Затем исследовательский интерес Никитиной Т.В. был сосредоточен на исследования генетических причин идиопатического привычного невынашивания беременности (ПНБ). Важное место среди них занимают хромосомные аномалии, частоты различных типов которых были исследованы в значительной по размерам выборке спонтанных абортусов. «Виртуальное кариотипирование» эмбрионов с помощью aCGH предоставляет новые возможности для более полного понимания масштабов хромосомного нерасхождения и субмикроскопических аномалий в эмбриональной гибели. Был проведен сравнительный анализ частот аномальных кариотипов у спорадических абортусов и эмбрионов от женщин с ПНБ. Показано, что у молодых женщин с ПНБ частоты аномальных кариотипов у эмбрионов меньше, чем при спорадических абортах. Проведен сравнительный анализ частот аномальных кариотипов у погибших эмбрионов при первичном и вторичном ПНБ, а также выявлено неслучайное распределение кариотипов эмбрионов у женщин с привычным невынашиванием беременности. Показано, что структура хромосомной патологии отличается между анэмбриониями и неразвивающимися беременностями, однако суммарная частота хромосомных аномалий при этих диагнозах не отличалась, что свидетельствует о необходимости поиска генетических причин анэмбрионии на других уровнях организации генома. Одним из подходов к исследованию причин невынашивания беременности, разрабатываемых в настоящее время, является использование стволовых клеток трофобласта в качестве клеточных моделей.

Кроме того, Никитиной Т.В. проводится изучение стабильности кариотипа индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК) от пациентов с хромосомными нарушениями. Были получены линии ИПСК с кольцевыми хромосомами 8, 13, 18 и 22, которые могут быть использованы для исследований «поведения» кольцевых хромосом в активно пролиферирующих клетках. Обнаружены различия в митотической стабильности различных кольцевых хромосом в ИПСК и выявлена самопроизвольная коррекция кариотипа с кольцевой хромосомой 8 путем потери кольца и образования однородительской дисомии хромосомы 8.

Т.В. Никитина является автором и соавтором более 100 печатных трудов.

Т.В. Никитина принимает активное участие в выполнении научных проектов, поддержанных в рамках Федеральных целевых программ, Российским фондом фундаментальных исследований, Российским научным фондом. 

Татьяна Владимировна показала, что феномен однородительской дисомии не вносит значимого вклада в эмбриональную смертность у человека (Никитина и др., 2004).

В рамках гранта РФФИ «Оценка частоты мутаций микросателлитных повторов ДНК при ранней эмбриональной гибели у человека» впервые были получены данные о высокой частоте соматических мутаций микросателлитных повторов в тканях спонтанных абортусов человека (Лебедев и др.,2006), тогда как статистически значимых отличий по частоте гаметических мутаций микросателлитов у супружеских пар со спонтанными абортами и родителей со здоровыми детьми обнаружено не было (Никитина, Назаренко, 2000; Никитина и др., 2005). Разработана математическая модель для оценки контаминации культур экстраэмбриональных фибробластов клетками матери (Nikitina et al., 2005). В помощь ординаторам и врачам генетикам и акушерам-гинекологам в 2013 году было издано учебно-методическое пособие «Цитогенетика нарушений эмбрионального развития человека» (Лебедев, Никитина, 2013). 

Татьяна Владимировна занимается анализом причин идиопатического привычного невынашивания беременности (Никитина, Лебедев, 2014). Показано, что у молодых женщин вклад цитогенетической патологии эмбриона в привычное невынашивание достоверно ниже, чем при спорадических эмбриональных потерях. Было выявлено существование неслучайного распределения кариотипов абортусов у некоторых женщин (Nikitina et al., 2016, Никитина и др., 2018, Nikitina et al., 2020). 

Показано, что структура хромосомной патологии отличается между анэмбриониями и неразвивающимися беременностями, и наличие эмбриона положительно ассоциировано с анеуплоидиями по половым хромосомам и триплоидиям, а отсутствие эмбриона – с тетраплоидиями, однако суммарная частота хромосомных аномалий при этих диагнозах не отличалась.

Разрабатывается экспериментальный подход к исследованию причин невынашивания беременности с использованием стволовых клеток трофобласта в качестве клеточных моделей (Nikitina, Lebedev, 2022).

Получены линии фибробластов от пациентов с микроструктурными аберрациями. Проводится исследование стабильности кариотипа индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (Никитина Т.В., Лебедев И.Н., 2018), в том числе генерированных из фибробластов пациентов с кольцевыми хромосомами (Nikitina et al., 2018a, Nikitina et al., 2018b). Показано, что кольцевые хромосомы отличаются по митотической стабильности как между линиями ИПСК с разными кольцами, так и, в некоторых случаях, между клеточными линиями с одной и той же кольцевой хромосомой. Мы зарегистрировали самопроизвольную нормализацию кариотипа 46,XY,r(8) до 46,XY за счет потери кольцевой хромосомы и дупликации нормального гомолога с формированием isoUPD(8)pat. Сделан вывод, что существует высокая вариабельность частоты вторичных перестроек как в культурах фибробластов, так и в культурах ИПСК, что расширяет клиническое значение конституциональных кольцевых хромосом (Nikitina et al.,2021).

Научные достижения Т.В. Никитиной отмечены Почетной грамотой администрации г.Томска (2015 г.) и Почетной грамотой Сибирского отделения РАН (2017). Присвоено звание «Заслуженный ветеран труда» (2019 г.)

1. Nikitina T.V., Lebedev I.N. Stem Cell-Based Trophoblast Models to Unravel the Genetic Causes of Human Miscarriages // Cells (2022) 11(12):1923. doi: 10.3390/cells11121923.

2. Nikitina T.V., Kashevarova A.A., Gridina M.M., Lopatkina M.E., Khabarova A.A., Yakovleva Y.S., Menzorov A.G., Minina Y.A., Pristyazhnyuk I.E., Vasilyev S.A., Fedotov D.A., Serov O.L., Lebedev I.N. Complex biology of constitutional ring chromosomes structure and (in)stability revealed by somatic cell reprogramming // Sci Rep. (2021) 11(1):4325. doi: 10.1038/s41598-021-83399-3.

3. T. V. Nikitina, E. A. Sazhenova, D. I. Zhigalina, E. N. Tolmacheva, N. N. Sukhanova, I. N. Lebedev. Karyotype evaluation of repeated abortions in primary and secondary recurrent pregnancy loss // J Assist Reprod Genet (2020) 37:517-525 DOI 10.1007/s10815-020-01703-y

4. Никитина Т.В., Кашеварова А.А., Лебедев И.Н. Хромосомная нестабильность и коррекция кариотипа в индуцированных плюрипотентных стволовых клетках человека // Генетика, 2019, том 55, № 10, с. 1–15

5. Nikitina T.V., Menzorov A.G., Kashevarova A.A., Gridina M.M., Khabarova A.A., Yakovleva Yu.S., Lopatkina M.E., Pristyazhnyuk I.E., Vasilyev S.A., Serov O.L., Lebedev I.N. Induced pluripotent stem cell line, IMGTi003-A, derived from skin fibroblasts of an intellectually disabled patient with ring chromosome 13 // Stem Cell Research. 2018a. Vol. 33. P. 260-264. doi: 10.1016/j.scr.2018.11.009.

6. Nikitina T.V., Menzorov A.G., Kashevarova A.A., Gridina M.M., Khabarova A.A., Yakovleva Yu.S., Lopatkina M.E., Kizilova E.A., Vasilyev S.A., Serov O.L., Lebedev I.N. Generation of two iPSC lines (IMGTi001-A and IMGTi001-B) from human skin fibroblasts with ring chromosome 22. Stem Cell Research. 2018. V.31. P.244–248.
   

7. Никитина Т.В., Жигалина Д.И., Саженова Е.А., Толмачева Е.Н., Скрябин Н.А., Лебедев И.Н. Неслучайное  распределение кариотипов эмбрионов у женщин с привычным  невынашиванием беременности // Медицинская генетика, 2018,  Т.17., N 1, Стр. 50-56.
   

8. Никитина Т.В., Лебедев И.Н. Регуляция стабильности кариотипа в индуцированных плюрипотентных стволовых клетках человека // Цитология, 2018, т.60, N6, С.403-416.
   

9. Nikitina T.V., Sazhenova E.A., Tolmacheva E.N., Sukhanova N.N., Kashevarova A.A., Skryabin N.A., Vasilyev S.A., Nemtseva T.N., Yuriev S.Y., Lebedev I.N. Comparative cytogenetic analysis of spontaneous abortions in recurrent and sporadic pregnancy losses //Biomedicine Hub. 2016. 1:446099. DOI: 10.1159/000446099

10. Никитина Т.В., Лебедев И.Н. Цитогенетика привычного невынашивания беременности // Генетика, 2014, том 50, № 5, с. 501–514.

11. Никитина Т.В., Кашеварова А.А., Скрябин Н.А., Чечеткина Н.Н., Мельников А.А., Лебедев И.Н. Молекулярное кариотипирование (aCGH) как современный подход к исследованию причин невынашивания беременности // Медицинская генетика. 2013. Том 12, № 1. С. 26-35.

12. Лебедев И.Н., Никитина Т.В. Цитогенетика нарушений эмбрионального развития человека (Наследственность и здоровье): учебно-методическое пособие – Томск: Изд-во «Печатная мануфактура», 2013. – 124с.

13. Лебедев И.Н., Кашеварова А.А., Скрябин Н.А., Никитина Т.В., Лопаткина М.Е., Мельников А.А., Саженова Е.А., Иванова Т.В., Евтушенко И.Д. Матричная сравнительная геномная гибридизация (array-CGH) в диагностике хромосомного дисбаланса и CNV-полиморфизма при анэмбрионии // Журнал акушерства и женских болезней. 2013. Том LXII, выпуск 2. С. 117-124.

14. Лебедев И.Н., Никитина Т.В., Токарева А.Г., Суханова Н.Н., Назаренко С.А. Патогенетические эффекты нестабильности эмбрионального генома в развитии человека // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2006. Т. 10. № 3. С. 520-530.

15. Nikitina T.V., Lebedev I.N., Sukhanova N.N., Sazhenova E.A., Nazarenko S.A. A mathematical model for evaluation of maternal cell contamination in cultured cells from spontaneous abortions: significance for cytogenetic analysis of prenatal selection factors // Fertility Sterility. 2005. V.83. № 4. P. 964-972.

16. Никитина Т.В., Лебедев И.Н., Суханова Н.Н., Назаренко С.А. Гаметические мутации тетрануклеотидных повторов ДНК в норме и патологии раннего периода онтогенеза человека // Генетика. 2005. Т. 41. № 7. С. 770-778.

17. Никитина Т.В., Саженова Е.А., Суханова Н.Н., Лебедев И.Н., Назаренко С.А. Оценка роли однородительской дисомии в ранней эмбриональной летальности человека // Онтогенез. 2004. Т.35. № 4. С.238-246.

18. Lebedev I.N., Ostroverkhova N.V., Nikitina T.V., Sukhanova N.N., Nazarenko S.A. Features of chromosomal abnormalities in spontaneous abortion cell culture failures detected by Interphase FISH analysis // European Journal of Human Genetics. 2004. V. 12. №7. P. 513-520.

19. Никитина Т.В., Назаренко С.А. Мутации в микросателлитных повторах ДНК и эмбриональная гибель человека // Генетика. 2000. Т.36. №7. С.965- 971.