Ученые Томского НИМЦ приняли участие в ведущей российской конференции в области биоинформатики

Ученые Томского НИМЦ приняли участие в ведущей российской конференции в области биоинформатики

В 2024 году 14-я Международная Мультиконференция «Биоинформатика регуляции и структуры геномов/системная биология» проходила с 5 по 10 августа в Новосибирске на базе Института цитологии и генетики СО РАН и Новосибирского государственного университета.

Конференция BGRS проводится раз в два года в течение 25 лет (начиная с 1998 года). Организаторы – Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирский государственный университет и Научный совет по биоинформатике СО РАН. Отличительная особенность BGRS/SB – ее мультидисциплинарность. В программу конференции входят симпозиумы и секции, рассматривающие широкий круг проблем, решение которых требует интеграции теоретических и экспериментальных подходов. Такая широкая тематика и привлечение ведущих мировых исследователей делают ее — ведущей российской конференцией в области биоинформатики.

В этом году в мероприятии приняли участие около тысячи ученых из разных стран. В программе конференции – 13 тематических симпозиумов, более 500 устных и около 300 стендовых докладов.

НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ выступил организатором симпозиума «Эволюционная, популяционная и медицинская геномика/генетика человека: компьютерные и экспериментальные подходы». Модераторы симпозиума: директор Томского НИМЦ, академик РАН Вадим Степанов и зам. директора по развитию Томского НИМЦ; ведущий научный сотрудник, руководитель лаборатории инструментальной геномики НИИ медицинской генетики, д-р биол. наук Станислав Васильев.

Современная генетика и молекулярная биология позволяют одновременно оценивать количество и состояние тысяч генов и белков. Объединение этих больших данных в единую картину требует развития принципиально новых подходов, в том числе с использованием искусственного интеллекта. BGRS - ведущая конференция в области системной биологии и биоинформатики. Она уже многие годы является одной из крупнейших площадок для обсуждения важнейших вопросов в области анализа больших генетических данных, выявления механизмов взаимодействия различных уровней организации клетки и организма, поиска механизмов патогенеза болезней человека и путей их лечения. Для биомедицинских исследователей участие в такой конференции - возможность увидеть новые возможности анализа своих результатов, знакомство со специалистами в области биоинформатики и системной биологии, — прокомментировал Станислав Васильев.

В секции «Медицинская геномика/генетика человека» данного симпозиума с устными докладами выступили:

  •  старший научный сотрудник отделения радионуклидной диагностики НИИ онкологии, врач-онколог первой квалификационной категории Ольга Брагина, доклад «Феномен сочетания болезней: роль генетических факторов в развитии синтропий и дистропий»;
  • младший научный сотрудник лаборатории эволюционной генетики НИИ медицинской генетики Анастасия Бабовская, доклад «Популяционная транскриптомика преэклампсии»;
  • младший научный сотрудник лаборатории онтогенетики НИИ медицинской генетики Дмитрий Федотов, доклад «Спектр CNV у пациентов с нарушениями психомоторного развития».

Стендовые доклады представили:

  • ученый секретарь НИИ медицинской генетики, научный сотрудник лаборатории популяционной генетики, канд. биол. наук Надежда Бабушкина, доклад «Выявление дифференциально метилированных при бронхиальной астме и туберкулезе легких генов (реанализ данных)»;
  • научный сотрудник лаборатории популяционной генетики НИИ медицинской генетики, канд. биол. наук Ирина Гончарова, доклад «Метилирование генов некодирующих РНК при аневризме и атеросклерозе восходящей аорты».

Научные сотрудники Томского НИМЦ приняли активное участие в работе симпозиума «Геномика, транскриптомика и биоинформатика».

  • Младший научный сотрудник лаборатории геномной идентификации НИИ медицинской генетики Мария Гавриленко представила доклад «Анализ событий альтернативного сплайсинга в децидуальных клетках плаценты человека».
  • Младший научный сотрудник лаборатории биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии Анна Хозяинова представила доклад «Выявление общей молекулярной программы эмбрио- и онкогенеза с помощью секвенирования РНК единичных клеток», который был поддержан спонсором конференции ООО «СкайДжин».

В секции «Популяционная и эволюционная геномика/генетика человека» симпозиума «Эволюционная, популяционная и медицинская геномика/генетика человека: компьютерные и экспериментальные подходы» представили устные доклады:

  • ведущий научный сотрудник лаборатории эволюционной генетики Научно-исследовательского института медицинской генетики, д-р биол. наук Владимир Харьков, доклад «Филогения и филогеография Y-хромосомной гаплогруппы N1a1a1a1a-F1419»;
  • младший научный сотрудник лаборатории геномной идентификации НИИ медицинской генетики Лариса Валихова, доклад «Генетическая структура ненцев по 21 аутосомному STR-маркеру»

Стендовые доклады в данной секции представили:

  • старший научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики и биохимии НИИ психического здоровья, канд. биол. наук «Ассоциация полиморфного варианта гена IL6 с тяжестью депрессивных симптомов» Наталья Вялова;
  • научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики и биохимии НИИ психического здоровья, канд. мед. наук Ирина Меднова, доклад «Ассоциация полиморфизма rs753482 гена eNOS с риском абдоминального ожирения у больных шизофренией, принимающих атипичные антипсихотики»;
  • старший научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики и биохимии НИИ психического здоровья, канд. мед. наук Людмила Смирнова, доклад «Использование инструмента MaxQuant для поиска бимаркеров БАР»

Со стендовыми докладами в симпозиуме «Биомедицина, биоинформатика и системная компьютерная биология» приняли участие:

  • старший научный сотрудник лаборатории эволюционной генетики НИИ медицинской генетики, канд. мед. наук Екатерина Трифонова, доклад «Преэклампсия: взгляд на патогенез заболевания через призму геномики и транскриптомики»;
  • младший научный сотрудник НИИ психического здоровья Александр Серегин, доклад «Количественные различия в белковом спектре сыворотки крови больных БАР с депрессивным и смешанным эпизодом».

С устным докладом «Сочетания вариантов митохондриальной ДНК как фактор риска развития нарушений сердечного ритма» в симпозиуме «Генетика и системная биология старения» выступила старший научный сотрудник лаборатории популяционной генетики Научно-исследовательского института медицинской генетики, канд. биол. наук Мария Голубенко.

С пленарным докладом «Омиксные технологии на уровне единичных клеток и пространственного разрешения: возможности и перспективы» в завершающий день конференции выступил заведующий лабораторией биологии опухолевой прогрессии НИИ онкологии, д-р биол. наук Евгений Денисов.