Научные интересы затрагивают эпигенетическую регуляцию генов, в частности метилирование ДНК и некодирующие РНК, при сердечно-сосудистых и митохондриальных заболеваниях.

Королёва Ю.А. является автором и соавтором более 80 статей в отечественных и зарубежных рецензируемых журналах («Генетика», «Молекулярная Биология», «Биохимия», «Медицинская генетика», «Российский кардиологический журнал», «PLoS ONE», «Scientific reports»).

С 2012 по 2025 г. - участие в качестве исполнителя в выполнении работ по грантовым проектам РФФИ, РНФ, ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России», по Гранту Президента Российской Федерации для государственной поддержки ведущих научных школ Российской Федерации.

Является лауреатом конкурсов молодых учёных, проведённых в рамках научных конференций:

Диплом I степени за доклад на английском языке на IV форуме «Кардиология XXI века: альянсы и потенциал» (апрель 2023 г.)

Дипломы III степени за доклады на Первом (апрель 2018) и Втором всероссийском научно-образовательном форуме с международным участием «Кардиология XXI века: альянсы и потенциал» (апрель 2021).

I место в конкурсе стендовых докладов на XI научной конференции «Генетика человека и патология» посвящённой 35-летию НИИ медицинской генетики (ноябрь 2017).

1. Kucher A.N., Koroleva Iu.A., Nazarenko M.S. Exploring Disparities in Atherosclerosis Comorbidity with Aortic Aneurysm // Biomedicines. 2025. Vol. 13. No 3. P. 593. – DOI 10.3390/biomedicines13030593 Режим доступа: https://www.mdpi.com/2227-9059/13/3/593

2. Кучер А.Н., Королёва Ю.А., Назаренко М.С. Эпидемиологическая основа коморбидности аневризмы аорты и атеросклероза сосудов // Бюллетень сибирской медицины. 2025. Т. 24. № 1. С. 180-192. – DOI 10.20538/1682-0363-2025-1-180-192. Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=82274229

3. Королёва Ю.А., Гончарова И.А., Зарубин А.А., Шипулина С.А., Слепцов А.А., Панфилов Д.С., Козлов Б.Н., Назаренко М.С. Разнонаправленное изменение уровня метилирования CPG-сайтов в 5' регионе гена TBX20 в восходящей аорте при атеросклерозе и аневризме // Генетика. 2024. Т. 60. № 7. С. 100-106. DOI 10.31857/S0016675824070091. Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=73160232 (Koroleva Iu.A., Goncharova I.A., Zarubin A.A., Shipulina S.A., Sleptsov A.A., Panfilov D.S., Kozlov B.N., Nazarenko M.S. Methylation Levels in the 5' Region of the TBX20 Gene in the Ascending Aorta Change in Opposite Direction in Atherosclerosis and Aneurysm // Russian Journal of Genetics. 2024. Vol. 60. No 7. P. 977-981. DOI 10.1134/S102279542470042X Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=68538087) 

4. Королёва Ю.А., Зарубин А.А., Бабушкина Н.П., Гомбоева Д.Е., Муслимова Э.Ф., Кузнецов М.С., Козлов Б.Н., Назаренко М.С. Анализ уровня метилирования предполагаемого регуляторного региона гена MIR100 при атеросклерозе сонных артерий методом таргетного бисульфитного секвенирования // Медицинская генетика. 2023. Т. 22. № 1. С. 43-46. DOI 10.25557/2073-7998.2023.01.43-46. Режим доступа: https://elibrary.ru/item.asp?id=50307854

5. Кучер А.Н., Королёва Ю.А., Зарубин А.А., Назаренко М.С. МикроРНК как потенциальные регуляторы инфицирования SARS-CоV-2 и модификаторы клинической картины COVID-19 // Молекулярная биология. 2022. Т. 56. № 1. С. 35-54. DOI 10.31857/S0026898422010049. Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=47696366 (Kucher A.N., Koroleva I.A., Zarubin A.A., Nazarenko M.S. MicroRNAs as the Potential Regulators of SARS-CoV-2 Infection and Modifiers of the COVID-19 Clinical Features // Molecular Biology. 2022. Vol. 56. No 1. P. 29-45. – DOI 10.1134/S0026893322010034 Режим доступа: https://link.springer.com/article/10.1134/S0026893322010034 )

6. Королёва Ю.А., Марков А.В., Гончарова И.А., Слепцов А.А., Бабушкина Н.П., Валиахметов Н.Р., Шарыш Д.В., Зарубин А.А., Кузнецов М.С., Козлов Б.Н., Назаренко М.С. Метилирование дезоксирибонуклеиновой кислоты в области энхансера генов CDKN2A/2b и CDKN2B-AS1 в сосудах и клетках крови у пациентов с атеросклерозом сонных артерий // Российский кардиологический журнал. 2020. Т. 25. № 10. С. 32-40. DOI 10.15829/1560-4071-2020-4060. Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=44193170

7. Королёва Ю.А., Марков А.В., Слепцов А.А., Зарубин А.А., Муслимова Э.Ф., Афанасьев С.А., Кузнецов М.С., Козлов Б.Н., Назаренко М.С. Анализ уровня метилирования гена MIR21 в сосудах и лейкоцитах крови при атеросклерозе сонных артерий методом таргетного бисульфитного секвенирования // Медицинская генетика. 2020. Т. 19. № 5 (214). С. 41-43. DOI 10.25557/2073-7998.2020.05.41-43. Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=44061488

8. Королёва Ю.А., Назаренко М.С., Кучер А.Н. Роль микроРНК в формировании нестабильности атеросклеротической бляшки // Биохимия. 2018. Т. 83. № 1. С. 34-46. Режим доступа: https://elibrary.ru/item.asp?id=32247024 (Koroleva I.A., Nazarenko M.S., Kucher A.N. Role of microRNA in development of instability of atherosclerotic plaques //Biochemistry (Moscow). 2017. V. 82. N. 11. P. 1380-1390. DOI: 10.1134/S0006297917110165 Режим доступа: https://link.springer.com/article/10.1134/S0006297917110165)

9. Королёва Ю.А., Зарубин А.А., Марков А.В., Казанцев А.Н., Барбараш О.Л., Назаренко М.С. Анализ связи уровня метилирования генов MIR10B и MIR21 в лейкоцитах крови с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий // Сибирский медицинский журнал. 2018. Т. 33. № 2. С. 77-82. DOI: 10.29001/2073-8552-2018-33-2-77-82. Режим доступа: https://elibrary.ru/item.asp?id=35296169

10. Nazarenko M.S.; Sleptcov A.A.; Lebedev I.N.; Skryabin N.A.; Markov A.V.; Golubenko M.V.; Koroleva I.A.; Kazancev A.N.; Barbarash O.L.; Puzyrev V.P. Genomic structural variations for cardiovascular and metabolic comorbidity // Scientific reports.  2017.  V. 7.  e.41268. DOI: 10.1038/srep41268 Режим доступа: https://www.nature.com/articles/srep41268

11. Nazarenko M.S., Markov A.V., Lebedev I.N., Freidin M.B., Sleptcov A.A., Koroleva I.A., Frolov A.V., Popov V.A., Barbarash O.L., Puzyrev V.P. A comparison of genome-wide DNA methylation patterns between different vascular tissues from patients with coronary heart disease // PloS ONE. 2015. V. 10. N. 4. P. 0122601. DOI:10.1371/journal.pone.0122601 Режим доступа: http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0122601