Приоритетным направлением научной деятельности является исследование генетических причин развития многофакторных заболеваний, феномена множественности болезней у индивидов, представляющего собой разные варианты сочетания (синтропии) или, наоборот, несочетания (дистропии) на фенотипическом уровне.

·         Диплом лауреата конкурса Томской области в сфере образования, науки, здравоохранения и культуры (2021);

·         Благодарность Совета ректоров Томской области (2018);

·         Почетный диплом Сибирского отделения Российской академии наук (2017);

·         Почетная грамота Администрации г. Томска за высокие достижения в научной деятельности и оказание высокоспециализированных медицинских услуг населению г. Томска, Томской области и Сибири (2015);

·         Диплом лауреата конкурса Томской области в сфере образования, науки, здравоохранения и культуры (2011).

Интеллектуальная собственность:

СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ РИСКА РАЗВИТИЯ БРОНХИАЛЬНОЙ АСТМЫ Огородова Л.М., Фрейдин М.Б., Черевко Н.А., Васильева М.В., Брагина Е.Ю., Салтыкова И.В. Патент на изобретение RU 2383019 C1, 27.02.2010. Заявка № 2008148685/15 от 09.12.2008.

КОЛЛЕКЦИЯ ГЕНЕТИЧЕСКИХ РЕСУРСОВ (БИОБАНК) Пузырев В.П., Буйкин С.В., Брагина Е.Ю., Конева Л.А. Свидетельство о регистрации базы данных RU 2012620971. Зарегистрирована в Реестре баз данных 21.09.2012.

ПРОГРАММА ДЛЯ ДОКЛИНИЧЕСКОЙ ДИАГНОСТИКИ ОСОБЕННОСТЕЙ КОГНИТИВНЫХ И ЭМОЦИОНАЛЬНО-АФФЕКТИВНЫХ НАРУШЕНИЙ У ПАЦИЕНТОВ С БОЛЕЗНЬЮ ГЕНТИНГТОНА Гомбоева Д.Е., Никитина М.А., Брагина Е.Ю., Алифирова В.М., Завадовская В.Д., Светлик М.В., Назаренко М.С., Ермолаева С.В. Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ RU 2022667986, 29.09.2022. Заявка № 2022666822 от 16.09.2022.

ПРОГРАММА ПО ОЦЕНКЕ ВЕРОЯТНОСТИ РАЗВИТИЯ КОГНИТИВНЫХ НАРУШЕНИЙ У ПАЦИЕНТОВ С БОЛЕЗНЬЮ ПАРКИНСОНА Никитина М.А., Брагина Е.Ю., Алифирова В.М., Ермолаева С.В., Завадовская В.Д., Гомбоева Д.Е., Светлик М.В., Назаренко М.С. Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ RU 2022668098, 04.10.2022. Заявка № 2022667274 от 22.09.2022.

СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ ТЕЧЕНИЯ САРКОИДОЗА ОРГАНОВ ДЫХАНИЯДенисова О.А., Брагина Е.Ю., Черногорюк Г.Э., Калачева Т.П., Федосенко С.В., Чернявская Г.М., Барановская Н.В., Бразовская Н.Г. Патент на изобретение RU 2810480 C1, 27.12.2023. Заявка № 2810480 от 17.11.2023.

Монографии:

Генетические факторы подверженности туберкулезу / А. А. Рудко [и др.]; науч. ред. В. П. Пузырев; ФГБНУ Томский НИМЦ РАН. — Новосибирск: Изд-во СО РАН, 2017. — 121 с. ISBN 978-5-7692-1564-3.

Статьи в журналах:

1.       Никитина М.А., Брагина Е.Ю., Назаренко М.С., Левчук Л.А., Иванова С.А., Бойко А.С., Гомбоева Д.Е., Королева Е.С., Алифирова В.М. Связь полиморфизма rs6265 гена BDNF с уровнем сывороточного нейротрофического фактора у пациентов с болезнью Паркинсона // Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. 2024;124(1):114-120.

2.       Bragina E.Yu., Gomboeva D.E., Saik O.V., Ivanisenko V.A., Freidin M.B., Nazarenko M.S., Puzyrev V.P. Apoptosis genes as a key to identification of inverse comorbidity of Huntington's disease and cancer // Int J Mol Sci. 2023;24(11):9385. doi:10.3390/ijms24119385

3.       Брагина Е.Ю., Пузырёв В.П. Генетическая канва герменевтики феномена сочетания болезней человека // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2023;27(1):7-17. https://doi.org/10.18699/VJGB-23-03

4.       Беспалова И.Д., Романов Д.С., Денисова О.А., Брагина Е.Ю., Кощавцева Ю.И., Митриченко У.М., Тетенева А.В., Калюжина Е.В., Поровский Я.В., Букреева Е.Б. Саркоидоз как ассоциированное с метаболическим синдромом заболевание // Бюллетень сибирской медицины. 2023;22(3):80-87. https://doi.org/10.20538/1682-0363-2023-3-80-87

5.       Брагина Е.Ю., Гончарова И.А., Жалсанова И.Ж., Немеров Е.В., Назаренко М.С., Фрейдин М.Б., Пузырев В.П. Генетическая коморбидность гипертонической болезни и бронхиальной астмы // Артериальная гипертензия. 2022;28(1):87-95.

6.       Брагина Е.Ю., Назаренко М.С., Пузырёв В.П. Молекулярное сходство многофакторных и менделевских болезней // Медицинская генетика. 2022;21(7):30-32.

7.       Кутас У.В., Федорова О.С., Брагина Е.Ю. Генетические факторы риска пищевой аллергии: обзор полногеномных исследований // Российский аллергологический журнал. 2022;19(4):494-507. https://doi.org/10.36691/RJA1582

8.       Гончарова И.А., Брагина Е.Ю., Жалсанова И.Ж., Фрейдин М.Б., Назаренко М.С. Регуляторный потенциал SNP-маркеров генов, ассоциированных с бронхиальной астмой, артериальной гипертензией и их коморбидным фенотипом // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2021;25(8):855-863. DOI: 10.1152/ajplung.00250.2022

9.       Брагина Е.Ю., Гончарова И.А., Жалсанова И.Ж., Немеров Е.В., Назаренко М.С., Фрейдин М.Б. Бронхиальная астма в структуре генетических связей синтропии сердечно-сосудистого континуума // Сибирский журнал клинической и экспериментальной медицины. 2021;36(4):52-61. https://doi.org/10.29001/2073-8552-2021-36-4-52-61

10.   Гомбоева Д.Е., Брагина Е.Ю., Назаренко М.С., Пузырев В.П. Обратная коморбидность между онкологическими заболеваниями и болезнью Гентингтона: обзор эпидемиологических и биологических доказательств // Генетика. 2020;56(3):260-271. DOI:10.31857/S0016675820030054

11.   Zolotareva, O., Saik, O.V., Königs, C. Bragina E.Yu., Goncharova I.A., Freidin M.B., Dosenko V.E., Ivanisenko V.A. & Hofestädt R. Comorbidity of asthma and hypertension may be mediated by shared genetic dysregulation and drug side effects // Sci Rep. 2019;9(1):16302. doi:10.1038/s41598-019-52762-w

12.   Bragina EY, Goncharova IA, Garaeva AF, Nemerov EV, Babovskaya AA, Karpov AB, Semenova YV, Zhalsanova IZ, Gomboeva DE, Saik OV, Zolotareva OI, Ivanisenko VA, Dosenko VE, Hofestaedt R, Freidin MB. Molecular Relationships between Bronchial Asthma and Hypertension as Comorbid Diseases // J Integr Bioinform. 2018;15(4):20180052. doi: 10.1515/jib-2018-0052

13.   Saik OV , Demenkov PS, Ivanisenko TV , Bragina EYu, Freidin MB, Goncharova IA, Dosenko VE, Zolotareva OI, Hofestaedt R, Lavrik IN, Rogaev EI and Ivanisenko VA Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks // BMC Med Genomics. 2018;11(Suppl 1):15. doi:10.1186/s12920-018-0331-4

14.   Shoshi A, Hofestädt R, Zolotareva O, et al. GenCoNet - A Graph Database for the Analysis of Comorbidities by Gene Networks // J Integr Bioinform. 2018;15(4):20180049. doi:10.1515/jib-2018-0049

15.   Drevytska T, Morhachov R, Tumanovska L, Portnichenko G, Nagibin V, Boldyriev O, Lapikova-Bryhinska T, Gurianova V, Dons'koi B, Freidin M, Ivanisenko V, Bragina EY, Hofestädt R, Dosenko V. shRNA-Induced Knockdown of a Bioinformatically Predicted Target IL10 Influences Functional Parameters in Spontaneously Hypertensive Rats with Asthma // J Integr Bioinform. 2018;15(4). doi: 10.1515/jib-2018-0053

16.   Saik OV, Demenkov PS, Ivanisenko TV, et al. Search for New Candidate Genes Involved in the Comorbidity of Asthma and Hypertension Based on Automatic Analysis of Scientific Literature. J Integr Bioinform. 2018;15(4):20180054. doi:10.1515/jib-2018-0054

17.   Брагин А.О., Соколов В.С., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Брагина Е.Ю., Матушкин Ю.Г., Иванисенко В.А. Программа ALLPRED для предсказания аллергенности бактерий и архей // Молекулярная биология. 2018;52(2):326-332.

18.   Vonk JM, Scholtens S, Postma DS, Moffatt MF, Jarvis D, Ramasamy A, Wjst M, Omenaas ER, Bouzigon E, Demenais F, Nadif R, Siroux V, Polonikov AV, Solodilova M, Ivanov VP, Curjuric I, Imboden M, Kumar A, Probst-Hensch N, Ogorodova LM, Puzyrev VP, Bragina EY, Freidin MB, Nolte IM, Farrall AM, Cookson WO, Strachan DP, Koppelman GH, Boezen HM. Adult onset asthma and interaction between genes and active tobacco smoking: The GABRIEL consortium // PLoS One. 2017;12(3):e0172716. doi: 10.1371/journal.pone.0172716. 2015/2016

19.   Брагина Е.Ю., Фрейдин М.Б., Бабушкина Н.П., Гараева А.Ф., Колоколова О.В., Жалсанова И.Ж., Пузырев В.П. Анализ генов цитокиновой сети в развитии «обратной» коморбидности для бронхиальной астмы и туберкулеза // Медицинская генетика. 2017;1 (175):20-24.

20.   Bragina EY, Tiys ES, Rudko AA, Ivanisenko VA, Freidin MB. Novel tuberculosis susceptibility candidate genes revealed by the reconstruction and analysis of associative networks // Infect Genet Evol. 2016;46:118-123. doi: 10.1016/j.meegid.2016.10.030

21.   Rudko A.A., Bragina E.Yu., V.P. Puzyrev, Freidin M.B. The genetics of susceptibility to tuberculosis: Progress and challenges // Asian Pacific Journal of Tropical Disease. 2016;6(9):680-684. doi: 10.1016/S2222-1808(16)61109-X

22.   Брагина Е.Ю., Фрейдин М.Б. Молекулярно-генетические исследования коморбидности // Бюллетень сибирской медицины. 2015;14(6):94-102. DOI:10.20538/1682-0363-2015-6-94-102.

23.   Rudko A.A., Garaeva A.F., Bragina E.Yu., Babushkina N.P., Kolokolova O.V., Lipaenkova O.N., Freidin M.B., Puzyrev V.P. Mutations in genes underlying atypical familial mycobacteriosis are not found in tuberculosis patients from Siberian populations // Tuberculosis (Edinb). 2015;95(2):204-7. doi: 10.1016/j.tube.2015.01.002

24.   Bragina E.Yu., Tiys E.S., Freidin M.B., Koneva L.A., Demenkov P.S., Ivanisenko V.A., Kolchanov N.A., Puzyrev V.P. Insights into pathophysiology of dystropy through the analysis of gene networks: an example of bronchial asthma and tuberculosis // Immunogenetics. 2014;66(7-8):457-65. doi: 10.1007/s00251-014-0786-1

25.   Saltykova I.V., Ogorodova L.M., Bragina E.Y., Puzyrev V.P., Freidin M.B. Opisthorchis felineus liver fluke invasion is an environmental factor modifying genetic risk of atopic bronchial asthma // Acta Trop. 2014;139:53-6. doi: 10.1016/j.actatropica.2014.07.004

26.   Scholtens S., Kerkhof M., Nolte I.M., Vonk J., Boezen H.M., Postma D.S., Koppelman G.H., Moffatt M.F., Cookson W.O.C.M., Jarvis D., Ramasamy A., Panasevich S., Melén E., Nyberg F., Pershagen G., Granell R., Henderson A.J., Wjst M., Svanes C., Bouzigon E. et al. Novel childhood asthma genes interact with in utero and early-life tobacco smoke exposure // J Allergy Clin Immunol. 2014;133(3):885-888. doi:10.1016/j.jaci.2013.08.049

27.   Фрейдин М.Б., Брагина Е.Ю., Салтыкова И.В., Деева Е.В., Огородова Л.М., Пузырев В.П. Влияние дополнительной болезни (коморбидности) на ассоциацию аллергического ринита с вариантом rs12621643 гена KCNE4 // Генетика. 2013;49(4):541–544.

28.   Фрейдин М.Б., Брагина Е.Ю., Федорова О.С., Деев И.А., Куликов Е.С., Огородова Л.М., Пузырев В.П. Полногеномный анализ ассоциаций аллергических заболеваний с молекулярными маркерами у русских жителей Западной Сибири // Молекулярная биология. 2011;45(3):464–472.

29.   Moffatt MF, Gut IG, Demenais F, Strachan DP, Bouzigon E, Heath S, von Mutius E, Farrall M, Lathrop M, Cookson WOCM; GABRIEL Consortium. A large-scale, consortium-based genomewide association study of asthma // N Engl J Med. 2010;363(13):1211-1221. doi: 10.1056/NEJMoa0906312