Этнический и географический аспекты распространенности полиморфных вариантов генов, ассоциированных с туберкулезом

Специфичность структуры генофондов различных этно-территориальных групп населения может быть основой эпидемических особенностей распространения туберкулеза (ТБ) и структуры генетической компоненты подверженности данной патологии. Изучена вариабельность 62 потенциально значимых для развития ТБ генетических вариантов у русского населения г. Томска и дана оценка дифференциации по этим маркерам различных этно-территориальных групп мира. Изученная выборка представлена 445 русскими жителями г. Томска без бронхолегочной патологии. Для сравнения привлечены данные о вариабельности исследованных маркеров в 26 популяциях, охарактеризованных в проекте “1000 геномов”. В томской популяции для семи из 58 исследованных SNP обнаружен только анцестральный аллель; частоты аллелей для 36 маркеров находятся в границах значений, показанных для других европеоидных популяций; по 12 SNP зарегистрированные частоты были ближе к популяциям с существенной монголоидной компонентой. По совокупности полиморфных маркеров томская популяция, несмотря на географическую удаленность от остальных европеоидных популяций, не отличается от них (согласно расчетам генетических дистанций и Gst-статистики), хотя и имеет некоторые особенности генофонда. Межпопуляционная дифференциация популяций мира по этим SNP отражает главным образом межрасовые различия. Наибольшие различия по генетической структуре между популяциями показаны по маркерам, локализованным в межгенных регионах. Установлены статистически значимые различия при сравнении уровней средней ожидаемой гетерозиготности между группами “популяций-носителей линии L4” микобактерий и популяций “не-L4”, что свидетельствует о влиянии на формирование популяционной специфичности аллельных частот данных маркеров распространенности разных патогенных линий M. tuberculosis.

Читать в источнике