Генетическое разнообразие Х-хромосомы в популяциях коренных этносов Сибири: структура неравновесия по сцеплению и филогеография гаплотипов локуса ZFX

Охарактеризована структура генофонда коренного населения Сибири по данным полиморфизма гена ZFX, расположенного на Х-хромосоме. В десяти изученных популяциях выявлено 49 гаплотипов, три из которых представлены с высокой частотой. При сравнении наших данных с данными проекта НарМар обнаружены уникальные “африканские” гаплотипы, которые встречаются с частотой 3-7 в популяции Йоруба (Нигерия) и не найдены в других популяциях. Коэффициент генетической дифференциации изученных этносов Сибири составляет 0.0486. Корреляционный анализ с использованием теста Мантеля не выявил значимых соответствий между матрицей генетических расстояний и матрицами географических, лингвистических и антропологических различий, но при этом несколько большие величины имеет коэффициент, полученный при сравнении с антропологической матрицей. Филогенетический анализ свидетельствует о существенной обособленности африканской популяции от остальных изученных этносов. Популяции Сибири подразделяются на два отдельных кластера: первый включает якутов, бурятов и кетов, второй  алтайцев, тувинцев и хантов. При использовании метода главных компонент удалось объединить изученные популяции в три группы, которые различаются между собой по степени выраженности европеоидного и монголоидного компонента. Первая группа включает в себя население Европы и одну из популяций хантов, вторая  популяции южной Сибири и Китая. В третью группу входят монголоидные популяции Восточной Сибири, японцы и кеты. Результаты барьерного анализа выявляют аналогичную структуру генетической дифференциации населения Сибири. Получена структура неравновесия по сцеплению для шести этнических групп Сибири. В пяти из них (за исключением популяции кетов) обнаружен единый блок сцепления по десяти SNP гена ZFX.

Читать в источнике