Основная область научных исследований Назаренко М.С. связана с изучением структурной и эпигенетической вариабельности генома соматических клеток в онтогенезе и при многофакторных заболеваниях.

Назаренко М.С. является автором около 200 печатных трудов, из них глава в монографии («Регенеративная биология и медицина», Москва - Омск - Томск - Ханты-Мансийск, 2017), 2 учебно-методических пособия («Генетические аспекты атеросклероза», Томск: Печатная мануфактура 2014; «Генетические аспекты интеллектуальных нарушений», Томск: Литературное бюро 2017), 63 статьи в ведущих отечественных и зарубежных рецензируемых журналах (таких как «Генетика», «Молекулярная Биология», «Биохимия», «Медицинская генетика», «Кардиология», «Российский кардиологический журнал», «Gene», «PLoS ONE», «Data in brief», «Scientific reports», «Stem Cell Research», «International Journal of Molecular Sciences»).

Назаренко М.С. участвует в выполнении грантов Российского Фонда Фундаментальных Исследований, Российского Научного Фонда. В частности, за последние 5 лет являлась руководителем грантов РНФ №16-15-10150, «Эпигенетические механизмы регуляции активности генов микроРНК при манифестном атеросклерозе у человека»; РФФИ № 20-315-90059, «Анализ вариабельности генов саркомерных белков при гипертрофии миокарда различного генеза»; РФФИ № 20-115-50414, «Регулом микроРНК при различных фенотипах атеросклероза», а также ответственным исполнителем грантов РФФИ № 16-04-00840, «Сравнительный анализ генетических основ фиброгенеза при некоторых патологических состояниях человека»; РНФ № 21-15-00065, «Создание клеточных моделей на основе индуцированных плюрипотентных стволовых клеток пациентов с семейной гиперхолестеринемией для исследования молекулярно-генетических основ атеросклероза».

Основные награды: лауреат Фонда содействия отечественной медицине (2008 г.); лауреат премии Томской области в сфере образования и науки в номинации «Премии научным и научно-педагогическим коллективам» (2011 г.); почетные грамоты администрации г. Томска (2011 г., 2015 г., 2017 г.); лауреат конкурса на лучшую российскую инновационную медицинскую технологию по медико-биологическому направлению на Первой Всероссийской научной конференции молодых учёных-медиков «Инновационные технологии в медицине XXI века» (2012 г.); диплом III степени за лучший устный доклад на VI съезде ВОГиС (2014 г.); благодарность Совета ректоров вузов Томской области за вклад в подготовку кадров, развитие научных исследований и в связи с празднованием Дня российской науки Председатель Совета ректоров вузов Томской области (2016 и 2019 гг.); почетная грамота президиума Сибирского отделения РАН за многолетний добросовестный труд, личный вклад в развитие медицинской академической науки в Сибири, обеспечение проведения научных исследований и в связи с 35-летием со дня основания НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ (2019 г.); благодарность за значительный вклад в развитие научной сферы и успехи, достигнутые в установленной сфере деятельности Министерства науки и высшего образования Российской Федерации (2021 г.).

Является членом диссертационного совета по защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук и ученой степени доктора наук по специальности 1.5.7. – генетика, ученого совета и научно-экспертного советов при НИИ медицинской генетики, Вавиловского общества генетиков и селекционеров, Российского общества медицинских генетиков, Национального общества по изучению атеросклероза, Европейского Общества по проблемам атеросклероза и Европейского общества генетики человека.

1. Nazarenko MS, Viakhireva IV, Skoblov MY, Soloveva EV, Sleptcov AA, Nazarenko LP. Meier-Gorlin Syndrome: Clinical Misdiagnosis, Genetic Testing and Functional Analysis of ORC6 Mutations and the Development of a Prenatal Test. Int J Mol Sci. 2022 Aug 17;23(16):9234. doi: 10.3390/ijms23169234. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9408996/

2. Назаренко М.С., Слепцов А.А., Пузырев В.П. “Менделевский код” в генетической структуре широко распространенных многофакторных заболеваний. Генетика. 2022. Т. 58. № 10. С. 1101-1111. https://elibrary.ru/item.asp?id=49422926

3. Кучер А.Н., Слепцов А.А., Назаренко М.С. Генетический ландшафт дилатационной кардиомиопатии. Генетика. 2022. Т. 58. № 4. С. 371-387. https://elibrary.ru/item.asp?id=48022734

4. Никитина М.А., Брагина Е.Ю., Назаренко М.С., Алифирова В.М. Роль аллелей с промежуточным количеством тринуклеотидных повторов при болезни Паркинсона и других нейродегенеративных заболеваниях. Журнал неврологии и психиатрии им. C.C. Корсакова. 2022. Т. 122. № 7. С. 42-50. https://elibrary.ru/item.asp?id=49225497

5. Кучер А.Н., Королёва Ю.А., Зарубин А.А., Назаренко М.С. МикроРНК как потенциальные регуляторы инфицирования SARS-CoV-2 и модификаторы клинической картины COVID-19. Молекулярная биология. 2022. Т. 56. № 1. С. 35-54. https://elibrary.ru/item.asp?id=47696366

6. Назаренко М.С., Королёва Ю.А., Зарубин А.А., Слепцов А.А. Регулом микрорнк при различных фенотипах атеросклероза. Молекулярная биология. 2022. Т. 56. № 2. С. 227-243. https://elibrary.ru/item.asp?id=47957950

7. Брагина Е.Ю., Гончарова И.А., Жалсанова И.Ж., Немеров Е.В., Назаренко М.С., Фрейдин М.Б., Пузырев В.П. Генетическая коморбидность гипертонической болезни и бронхиальной астмы. Артериальная гипертензия. 2022. Т. 28. № 1. С. 87-95. https://elibrary.ru/item.asp?id=48531136

8. Oshchepkov D., Chadaeva I., Kozhemyakina R., Zolotareva K., Khandaev B., Sharypova E., Ponomarenko P., Bogomolov A., Klimova N.V., Shikhevich S., Redina O., Kolosova N.G., Kolchanov N.A., Markel A., Ponomarenko M., Nazarenko M. Stress reactivity, susceptibility to hypertension, and differential expression of genes in hypertensive compared to normotensive patients. International Journal of Molecular Sciences. 2022. Т. 23. № 5. doi: 10.3390/ijms23052835. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8911431/

9. Zakharova I.S., Shevchenko A.I., Elisaphenko E.A., Zakian S.M., Tmoyan N.A., Zubkova E.S., Ezhov M.V., Kukharchuk V.V., Parfyonova Y.V., Sleptcov A.A., Nazarenko M.S. Induced pluripotent stem cell line ICGI036-A generated by reprogramming peripheral blood mononuclear cells from a patient with familial hypercholesterolemia caused due to compound heterozygous p.Ser177Leu/p.Cys352Arg mutations in LDLR. Stem Cell Research. 2022. Т. 59. С. 102653. doi: 10.1016/j.scr.2022.102653. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34999421/

10. Салахов Р.Р., Голубенко М.В., Павлюкова Е.Н., Кучер А.Н., Бабушкина Н.П., Валиахметов Н.Р., Марков А.В., Беляева Е.О., Канев А.Ф., Назаренко М.С. Опыт молекулярно-генетической диагностики гипертрофической кардиомиопатии с использованием нанопорового секвенирования ДНК. Российский кардиологический журнал. 2021. Т. 26. № 10. С. 36-41. https://russjcardiol.elpub.ru/jour/article/view/4673?locale=ru_RU

11. Miroshnikova V.V., Panteleeva A.A., Pobozheva I.A., Razgildina N.D., Pchelina S.N., Polyakova E.A., Belyaeva O.D., Berkovich O.A., Baranova E.I., Markov A.V., Nazarenko M.S., Puzyrev V.P. ABCA1 and ABCG1 DNA methylation in epicardial adipose tissue of patients with coronary artery disease. BMC Cardiovascular Disorders. 2021. Т. 21. № 1. doi: 10.1186/s12872-021-02379-7. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8627066/

12. Sleptcov A.A., Zarubin A.A., Bogaychuk P.M., Nazarenko M.S., Kuznetsov M.S., Kozlov B.N. Human exome sequence data in support of somatic mosaicism in carotid atherosclerosis. Data in Brief. 2021. Т. 39. С. 107656.       doi: 10.1016/j.dib.2021.107656. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34917707/

13. Гомбоева Д.Е., Брагина Е.Ю., Назаренко М.С., Пузырев В.П. Обратная коморбидность между онкологическими заболеваниями и болезнью Гентингтона: обзор эпидемиологических и биологических доказательств // Генетика. 2020. Т.56, № 3. С. 260-271. https://elibrary.ru/item.asp?id=42366035

14. Ponomarenko M, Rasskazov D, Chadaeva I, Sharypova E, Drachkova I, Oshchepkov D, Ponomarenko P, Savinkova L, Oshchepkova E, Nazarenko M, Kolchanov N. Candidate SNP Markers of Atherogenesis Significantly Shifting the Affinity of TATA-Binding Protein for Human Gene Promoters show stabilizing Natural Selection as a Sum of Neutral Drift Accelerating Atherogenesis and Directional Natural Selection Slowing It. Int J Mol Sci. 2020 Feb 5;21(3). pii: E1045. doi:10.3390/ijms21031045. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7037642/

15. Назаренко М.С., Марков А.В., Слепцов А.А., Королёва Ю.А., Шарыш Д.В., Зарубин А.А., Валиахметов Н.Р., Гончарова И.А., Пузырев В.П., Муслимова Э.Ф., Панфилов Д.С., Козлов Б.Н., Афанасьев С.А. Сравнительный анализ экспрессии генов в клетках сосудов у больных с клинически выраженным атеросклерозом // Биомедицинская химия. 2018. Т. 64(5). С. 416-422. doi: 10.18097/PBMC20186405416. http://pbmc.ibmc.msk.ru/ru/article-ru/PBMC-2018-64-5-416/

16. Королева Ю.А., Назаренко М.С., Кучер А.Н. Роль микроРНК в формировании нестабильности атеросклеротических бляшек // Биохимия. 2018. Т. 83. № 1. С. 34-46. https://elibrary.ru/item.asp?id=32247024

17. Назаренко Л.П., Назаренко М.С., Салюкова О.Н., Лебедев И.Н. Генетические аспекты интеллектуальных нарушений / под ред. академика РАН В.П. Пузырева. ISВN 978-5-9908051-3-2 - Вып. 14. Сер. Наследственность и здоровье. – Томск: Литературное бюро, 2017. – 68 с.

18. Назаренко М.С., Марков А.В., Королева Ю.А., Слепцов А.А., Казанцев А.Н., Барбараш О.Л., Пузырев В.П. Идентификация дифференциально метилированных генов, потенциально связанных с атеросклерозом у человека. Российский кардиологический журнал. 2017;(10):42-48. https://russjcardiol.elpub.ru/jour/article/view/2386/2179

19. Кучер А.Н., Назаренко М.С., Марков А.В., Королева Ю.А., Барбараш О.Л. Вариабельность профилей метилирования CpG-сайтов генов микроРНК в лейкоцитах и тканях сосудов при атеросклерозе у человека. Биохимия. 2017. Т. 82. № 6. С. 923-933. http://protein.bio.msu.ru/biokhimiya/contents/v82/full/82060923.html

20. Nazarenko M.S., Sleptcov A.A., Lebedev I.N., Skryabin N.A., Markov A.V., Golubenko M.V., Koroleva I.A., Kazancev A.N., Barbarash O.L., Puzyrev V.P. Genomic structural variations for cardiovascular and metabolic comorbidity. Sci Rep. 2017 Jan 25;7:41268. doi:10.1038/srep41268. https://www.nature.com/articles/srep41268

21.