В состав Центра вошли Институты Томского научного центра медицинского профиля (Томский НИИ онкологии, НИИ кардиологии, НИИ фармакологии и регенеративной медицины имени Е.Д. Гольдберга, НИИ медицинской генетики, НИИ психического здоровья и НИИ акушерства, гинекологии и перинатологии) (Приказ Томского НИМЦ № 72-П от 01.07.2016 г. "О завершении процедуры реорганизации"). НИИ медицинской генетики вошел в состав созданного Центра как структурное подразделение. Временно исполняющим обязанности директора назначен д-р биол наук, профессор Степанов Вадим Анатольевич.